В minecraft от 25 до 60 fps, но видеокарта загружена на 30 % (gtx 1060 3gb)

Видеокарта не загружается выше 30% и бывают просадки до 25

А процессор?

Дай угадать, процессор бьет 100%

Тут дело в том, какой ещё у тебя процессор. Если у тебя процессор слабый, то естественно может быть так что процессор работает под 100% а видеокарта всего лишь на 30%.