Точнее как. Поддержка вроде как есть, так как NEI показывает что в крафте предмета можно использовать схемы из Mekanism, но при выкладке рецепта на верстаке, крафт не производится.
Это к разработчикам плагинов, чтобы они друг с Другом подружились.
У меня к примеру EZ Storafe тоже не дружит с Super Factory Manager.
Ничего не поделаешь.